Η απόφαση ένταξης ή όχι λαμβάνει υπόψη το Φύλλο Αξιολόγησης, τις γνωμοδοτήσεις των υπουργείων, τον Πίνακα Κατάταξης Προτάσεων με τήρηση της σειράς επιλογής τους (στην συγκριτική αξιολόγηση) και την τήρηση της σειράς προτεραιότητας υποβολής και διαδικασίας ένταξης/απόρριψης/αναστολής των προηγουμένων Προτάσεων.